A Escola de Programação tem como seu principal objetivo formar novos pesquisadores a fim de desenvolver sistemas para o Laboratório de Inovação tecnológica em saúde (LAIS) e para a rede de saúde pública. Os alunos trabalham através do método de Aprendizado Baseado em Problemas (PBL). O PBL é uma proposta pedagógica que consiste no ensino focado no estudante e baseado na solução de problemas. Sendo assim, os alunos desenvolvem softwares e aplicações para a resolução de problemas reais internos do hospital, da rede de saúde pública, do LAIS e da Escola, com a supervisão de dois tutores. Trata-se de um ganho mútuo. os departamentos do hospital necessitam de uma ferramenta para solucionar seus problemas e os alunos precisam de prática para aprender a desenvolver sistemas.
